สโคโปลินเป็นสารประกอบที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพหลายด้าน โดยมักถูกใช้ในการวิจัยทางชีววิทยาและเภสัชวิทยาเพื่อศึกษาคุณสมบัติของสารต้านอนุมูลอิสระ ช่วยป้องกันความเสียหายของเซลล์จากความเครียดออกซิเดทีฟ นอกจากนี้ยังมีการศึกษาเกี่ยวกับฤทธิ์ต้านการอักเสบ ซึ่งอาจนำไปพัฒนาเป็นสารช่วยลดการอักเสบในร่างกายได้ ในด้านการแพทย์ทางเลือก สโคโปลินมักพบในพืชสมุนไพรบางชนิดที่ใช้รักษาอาการปวด หรือปัญหาทางระบบประสาท โดยเชื่อว่ามีส่วนช่วยในการปรับสมดุลของระบบประสาท อย่างไรก็ตาม การใช้สารนี้ยังต้องอยู่ภายใต้การศึกษาและควบคุมอย่างเข้มงวด เนื่องจากอาจมีผลข้างเคียงหากใช้ในปริมาณสูง สโคโปลินยังถูกนำมาใช้ในงานวิจัยด้านสิ่งแวดล้อม โดยเฉพาะการติดตามการเคลื่อนที่ของน้ำในพืช เนื่องจากมีคุณสมบัติเป็นตัวติดตามทางชีวภาพที่สามารถตรวจจับได้ง่ายในระบบนิเวศ