ฟรักซิเนลโลนถูกใช้เป็นสารตั้งต้นในการพัฒนาสารกำจัดแมลง โดยเฉพาะในกลุ่มแมลงศัตรูพืช เช่น เพลี้ยไฟ เพลี้ยอ่อน และหนอนเจาะผล เนื่องจากมีฤทธิ์ทำให้แมลงเกิดการเป็นอัมพาตและตายในระยะสั้น นอกจากนี้ยังแสดงฤทธิ์ยับยั้งการเจริญเติบโตของแมลงในระยะตัวอ่อน ทำให้ไม่สามารถพัฒนาเป็นตัวเต็มวัยได้ ในงานวิจัยบางชิ้น ฟรักซิเนลโลนยังถูกศึกษาในด้านฤทธิ์ทางชีวภาพอื่น เช่น ฤทธิ์ต้านการอักเสบ และฤทธิ์ต้านเชื้อรา ซึ่งอาจนำไปสู่การพัฒนาเป็นสารออกฤทธิ์ในผลิตภัณฑ์เกษตรหรือยาในอนาคต อย่างไรก็ตาม การใช้งานในเชิงพาณิชย์ยังอยู่ในขั้นตอนการวิจัยและพัฒนา เนื่องจากต้องศึกษาความปลอดภัยต่อสิ่งแวดล้อมและสิ่งมีชีวิตที่ไม่ใช่เป้าหมายเพิ่มเติม