Erythromycin estolate ใช้กันอย่างแพร่หลายในการรักษาการติดเชื้อแบคทีเรียต่างๆ โดยเฉพาะที่เกิดจากเชื้อจุลินทรีย์ที่ไวต่อยา มักสั่งจ่ายสำหรับการติดเชื้อในระบบทางเดินหายใจ เช่น หลอดลมอักเสบและปอดบวม รวมถึงการติดเชื้อที่ผิวหนังและเนื้อเยื่ออ่อน นอกจากนี้ยังมีประสิทธิภาพในการรักษาการติดเชื้อทางเพศสัมพันธ์บางชนิด เช่น ซิฟิลิสและคลามีเดีย รวมถึงการติดเชื้อในหู โรคไอกรน และโรคเลปโตสไปโรซิส

ในการดูแลเด็ก Erythromycin estolate มักเลือกใช้เนื่องจากมีรูปแบบของเหลวที่รสชาติดี ทำให้ง่ายต่อการให้ยาเด็ก และใช้เป็นทางเลือกสำหรับผู้ป่วยที่แพ้เพนิซิลลิน

นอกเหนือจากการใช้งานต้านจุลชีพ Erythromycin estolate บางครั้งใช้ในการจัดการความผิดปกติของการเคลื่อนไหวทางเดินอาหารเนื่องจากผลโปรคิเนติก แม้ว่าจะไม่ใช่ข้อบ่งชี้หลัก

กิจกรรมสเปกตรัมกว้างและความเป็นพิษต่ำค่อนข้างทำให้เป็นตัวเลือกที่มีคุณค่าในการปฏิบัติทางคลินิก โดยเฉพาะในกรณีที่ยาปฏิชีวนะอื่นอาจมีประสิทธิภาพน้อยกว่า หรือห้ามใช้ การใช้ยานี้ควรอยู่ภายใต้การดูแลของแพทย์เพื่อป้องกันผลข้างเคียงและความเสี่ยงต่อตับ