ดอโนไมซิโนน (Daunomycinone) เป็นสารกลางสำคัญในการสังเคราะห์ยาปฏิชีวนะกลุ่มแอนทราคycline เช่น ดอโนรูบิซิน (daunorubicin) และดอกซอร์ูบิซิน (doxorubicin) ซึ่งใช้ในเคมีบำบัดรักษามะเร็ง โดยเฉพาะมะเร็งเม็ดเลือดขาวและเนื้องอกแข็ง สารนี้เป็นแกนหลัก (aglycone) ของยาเหล่านี้ ช่วยให้ยาที่ได้สามารถแทรกตัวเข้าไปในดีเอ็นเอและยับยั้งเอนไซม์ topoisomerase II ป้องกันการแบ่งตัวของเซลล์มะเร็ง นอกจากนี้ โครงสร้างของดอโนไมซิโนนยังช่วยในการปรับแต่งทางเคมีเพื่อเพิ่มประสิทธิภาพและลดผลข้างเคียงของยาสุดท้าย