ใช้หลัก ๆ เป็นยาปฏิชีวนะในการรักษาการติดเชื้อแบคทีเรีย โดยเฉพาะที่เกิดจากแบคทีเรียอะนาเอโรบิกและบางแบคทีเรียแกรมบวก มักถูกปรุงเป็นรูปแบบทาและรับประทานสำหรับการจัดการสิว vulgaris ปานกลางถึงรุนแรง เนื่องจากคุณสมบัติต้านการอักเสบและต้านจุลินทรีย์ นอกจากนี้ ยังใช้ในผู้ป่วยที่แพ้เพนิซิลลินสำหรับรักษาการติดเชื้อทางเดินหายใจ การติดเชื้อผิวหนังและเนื้อเยื่ออ่อน และการติดเชื้อกระดูก/ข้อ รูปแบบเอสเตอร์ palmitate ช่วยปรับปรุงรสชาติและมักใช้ในน้ำยารับประทานสำหรับเด็ก ซึ่งจะถูกไฮโดรไลซ์ในร่างกายเพื่อปล่อยคลินดามัยซินที่ออกฤทธิ์ มีประสิทธิภาพต่อ methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA) ในบางกรณี ทำให้มีคุณค่าในการรักษาการติดเชื้อที่เกิดในชุมชน