ฟลูเบนดาโซลเป็นสารต้านพยาธิชนิดหนึ่งที่ใช้ในการรักษาการติดเชื้อพยาธิในสัตว์และการแพทย์ โดยเฉพาะพยาธิในระบบทางเดินอาหาร เช่น พยาธิแอนติสโตม่า พยาธิไส้เดือน และพยาธิเข็มหมุด มีการใช้ในสัตว์เลี้ยงและสัตว์เศรษฐกิจ เช่น วัว แกะ แพะ และสุกร เพื่อควบคุมการแพร่ระบาดของพยาธิและช่วยเพิ่มประสิทธิภาพการเจริญเติบโต นอกจากนี้ ฟลูเบนดาโซลยังอยู่ระหว่างการวิจัยเพื่อศึกษาศักยภาพในการต้านมะเร็ง เนื่องจากพบว่าสามารถยับยั้งการแบ่งตัวของเซลล์มะเร็งได้ในห้องปฏิบัติการ โดยเฉพาะในเซลล์มะเร็งบางประเภท เช่น มะเร็งลำไส้ใหญ่ มะเร็งเต้านม และมะเร็งเม็ดเลือดขาว อย่างไรก็ตาม การใช้ในมนุษย์เพื่อรักษามะเร็งยังไม่ได้รับการอนุมัติ และต้องรอผลการศึกษาเพิ่มเติมจากคลินิก