ซัลฟาซาลาซีนใช้เป็นหลักในการรักษาโรคลำไส้อักเสบเรื้อรัง เช่น โรคกระเพาะลำไส้อักเสบ (ulcerative colitis) และโรคโครห์น โดยช่วยลดการอักเสบในลำไส้ นอกจากนี้ยังใช้รักษาโรคข้ออักเสบรูมาตอยด์ เพื่อลดอาการปวด บวม และแข็งของข้อต่อ ยาแตกตัวโดยแบคทีเรียในลำไส้ใหญ่ ปล่อยส่วนประกอบที่ออกฤทธิ์ยับยั้งกระบวนการอักเสบแบบเฉพาะที่ ด้วยผล immunomodulatory อาจช่วยรักษาการบรรเทาอาการในโรคเรื้อรังและลดความจำเป็นในการใช้คอร์ติโคสเตียรอยด์