สารประกอบนี้ใช้เป็นหลักในการสังเคราะห์เปปไทด์ในฐานะอนุพันธ์กรดอะมิโนที่ได้รับการป้องกัน โดยทำหน้าที่เป็นหน่วยย่อยในการสังเคราะห์เปปไทด์แบบเฟสตายตัว (SPPS) ซึ่งกลุ่มฟลูออเรนิลเมท็อกซีคาร์บอนิล (Fmoc) ทำหน้าที่เป็นกลุ่มป้องกันสำหรับหมู่อะมิโน กลุ่ม m-tolyl ในโครงสร้างให้คุณสมบัติด้าน steric และ electronic ที่สามารถส่งผลต่อการกำหนดทิศทาง (conformation) และปฏิสัมพันธ์ของเปปไทด์ สารนี้มีประโยชน์โดยเฉพาะในการสังเคราะห์เปปไทด์และโปรตีนที่ซับซ้อน ทำให้สามารถควบคุมลำดับและโครงสร้างได้อย่างแม่นยำ นอกจากนี้ การประยุกต์ใช้ยังขยายไปสู่การพัฒนายาที่มีฐานเป็นเปปไทด์ ซึ่งต้องการการปรับแต่งเฉพาะเพื่อเพิ่มความเสถียร bioavailability หรือความสามารถในการจับเป้าหมาย