Fmoc-3,4-difluoro-L-homophenylalanine เป็นสารเคมีที่ใช้อย่างแพร่หลายในการสังเคราะห์เปปไทด์ โดยเฉพาะในกระบวนการ solid-phase peptide synthesis (SPPS) ซึ่งเป็นเทคนิคที่นิยมใช้ในการสร้างเปปไทด์ในห้องปฏิบัติการ สารนี้ทำหน้าที่เป็นหน่วยสร้าง (building block) ที่สำคัญในการนำกรดอะมิโนเข้าสู่สายเปปไทด์ โดยกลุ่ม Fmoc (Fluorenylmethyloxycarbonyl) ช่วยในการป้องกันกลุ่มฟังก์ชันอลที่ไม่ต้องการให้เกิดปฏิกิริยาในระหว่างกระบวนการสังเคราะห์ นอกจากนี้ การที่มีฟลูออรีนสองอะตอมในโครงสร้างของสารนี้ยังช่วยเพิ่มความเสถียรและปรับปรุงคุณสมบัติทางกายภาพของเปปไทด์ที่สังเคราะห์ได้ เช่น การเพิ่มความทนทานต่อการสลายตัวทางชีวภาพ หรือการปรับปรุงการจับกับเป้าหมายทางชีวภาพ สารนี้จึงมักถูกนำไปใช้ในการวิจัยและพัฒนายา รวมถึงการศึกษาทางชีวเคมีและเภสัชวิทยา เพื่อสร้างโมเลกุลที่มีฤทธิ์เฉพาะเจาะจงและมีประสิทธิภาพสูง