ไอโอไดด์พาลลาเดียม(II) ใช้หลัก ๆ ในกระบวนการสังเคราะห์สารเคมีอินทรีย์เป็นตัวเร่งปฏิกิริยาสำหรับปฏิกิริยาเคมีต่าง ๆ โดยมีบทบาทสำคัญในปฏิกิริยาครอสคัปปลิ้ง เช่น ปฏิกิริยา Suzuki-Miyaura และ Heck ซึ่งจำเป็นสำหรับการสร้างพันธะคาร์บอน-คาร์บอนในการผลิตยา สารเคมีเกษตร และวัสดุขั้นสูง นอกจากนี้ ยังใช้ในการสังเคราะห์โมเลกุลอินทรีย์ที่ซับซ้อน รวมถึงผลิตภัณฑ์จากธรรมชาติและเคมีภัณฑ์ละเอียด ไอโอไดด์พาลลาเดียม(II) ยังถูกนำไปใช้ในการเตรียมคอมเพล็กซ์พาลลาเดียม ซึ่งทำหน้าที่เป็นสารตั้งต้นสำหรับการใช้งานตัวเร่งปฏิกิริยาเพิ่มเติม ความสามารถในการอำนวยการเปลี่ยนแปลงแบบเลือกสรรทำให้มีคุณค่าต่อกระบวนการวิจัยและอุตสาหกรรม