Tri-n-butyltin trifluoromethanesulfonate ใช้เป็นตัวเร่งปฏิกิริยาในกระบวนการสังเคราะห์อินทรีย์ โดยเฉพาะอย่างยิ่งในการส่งเสริมปฏิกิริยาการเอสเทอร์ไฟฟิเคชันและทรานส์เอสเทอร์ไฟฟิเคชัน ซึ่งช่วยในการก่อตัวของเอสเตอร์จากกรดคาร์บอกซิลิกและแอลกอฮอล์ สารประกอบนี้ยังถูกนำมาใช้ในการสังเคราะห์โมเลกุลอินทรีย์ที่ซับซ้อน รวมถึงผลิตภัณฑ์จากธรรมชาติและยา เนื่องจากความสามารถในการอำนวยการก่อตัวพันธะคาร์บอน-คาร์บอน นอกจากนี้ ยังมีการประยุกต์ใช้ในการเตรียมโพลิเมอร์และเรซิน โดยทำหน้าที่เป็นสารยึดเกาะหรือสารเชื่อมขวาง ซึ่งช่วยเพิ่มคุณสมบัติของวัสดุ ลักษณะกรดลิวอิสที่แข็งแกร่งทำให้มีคุณค่าต่อกระบวนการเร่งปฏิกิริยาต่างๆ รวมถึงปฏิกิริยา Friedel-Crafts แบบอัลไคเลชันและอะซิเลชัน