แอมซาครีน ไฮโดรคลอไรด์ใช้หลักในการรักษาโรคมะเร็งเม็ดเลือดขาวชนิดเฉียบพลัน โดยเฉพาะมะเร็งเม็ดเลือดขาวชนิดไมอิลอยด์ (AML) มันทำหน้าที่เป็นยาต้านมะเร็งโดยการแทรกตัวเข้าไปใน DNA ซึ่งรบกวนกระบวนการสำเนาและยับยั้งการเจริญเติบโตของเซลล์มะเร็ง สารประกอบนี้มักให้ทางหลอดเลือดดำในสถานพยาบาลและเป็นส่วนหนึ่งของการรักษาด้วยเคมีบำบัดแบบผสมผสานเพื่อเพิ่มประสิทธิภาพ การใช้ต้องได้รับการตรวจสอบอย่างใกล้ชิดเนื่องจากผลข้างเคียงที่อาจเกิดขึ้น เช่น การกดการสร้างเม็ดเลือดและพิษต่อหัวใจ แอมซาครีน ไฮโดรคลอไรด์แสดงกิจกรรมที่สำคัญในการเหนี่ยวนำการทุเลาในผู้ป่วย AML ที่ดื้อหรือกำเริบ ทำให้เป็นตัวเลือกที่มีคุณค่าในด้านมะเร็งวิทยา