ไพรารูบิซิน ไฮโดรคลอไรด์ถูกใช้เป็นหลักในการรักษามะเร็งหลายชนิด เช่น มะเร็งเต้านม มะเร็งกระเพาะปัสสาวะ และมะเร็งเม็ดเลือดขาวบางชนิด โดยทำงานโดยการยับยั้งการสังเคราะห์ DNA และ RNA ทำให้เซลล์มะเร็งไม่สามารถแบ่งตัวและเจริญเติบโตได้ ยานี้มักถูกให้ทางหลอดเลือดดำเป็นส่วนหนึ่งของการรักษาด้วยเคมีบำบัด โดยใช้เดี่ยวหรือร่วมกับยาต้านมะเร็งอื่นๆ เพื่อลดขนาดเนื้องอกและชะลอความก้าวหน้าของโรค นอกจากนี้ ยังใช้ในการรักษาแบบใส่ยาเข้าต่อมกระเพาะปัสสาวะสำหรับมะเร็งกระเพาะปัสสาวะตื้น เพื่อลดผลข้างเคียงระบบทั่วไป การใช้ยานี้อาจมีผลข้างเคียง เช่น การกดการสร้างเม็ดเลือดในไขกระดูก พิษต่อหัวใจ คลื่นไส้ อาเจียน และผมร่วง จึงต้องมีการตรวจสอบและดูแลอย่างใกล้ชิดจากแพทย์