เกลือไดโซเดียมของกัวโนซีน 5'-ไตรฟอสเฟต ถูกใช้อย่างแพร่หลายในการวิจัยทางชีวเคมีในฐานะแหล่งพลังงานที่สำคัญและสารตั้งต้นสำหรับปฏิกิริยาเอนไซม์ มันมีบทบาทสำคัญในการสังเคราะห์กรดนิวคลีอิก โดยทำหน้าที่เป็นส่วนประกอบพื้นฐานสำหรับ RNA ระหว่างการถอดรหัส (transcription) นอกจากนี้ ยังจำเป็นสำหรับการสังเคราะห์โปรตีน โดยให้พลังงานสำหรับการยืดสายโพลีเปปไทด์ สารประกอบนี้ยังถูกนำมาใช้ในเส้นทางส่งสัญญาณ (signal transduction) โดยทำหน้าที่เป็นสารตั้งต้นสำหรับ G-proteins ซึ่งควบคุมการตอบสนองของเซลล์ต่อสิ่งกระตุ้นภายนอก ในชีววิทยาโมเลกุล มันมักถูกใช้ใน PCR และเทคนิคขยายอื่นๆ เพื่อให้แน่ใจถึงการจำลอง DNA ที่มีประสิทธิภาพ นอกจากนี้ ยังใช้ในการศึกษาการเผาผลาญของเซลล์ การถ่ายโอนพลังงาน และจลนศาสตร์เอนไซม์ ซึ่งให้ข้อมูลเชิงลึกเกี่ยวกับหน้าที่และกลไกของเซลล์ ความเสถียรและความละลายของมันทำให้เป็นตัวเลือกที่เหมาะสมสำหรับการทดลองในหลอดทดลองและการทดสอบวินิจฉัย