ยูริดีน 5-ไดฟอสเฟต โซเดียมซอลต์ ถูกใช้อย่างแพร่หลายในงานวิจัยทางชีวเคมีในฐานะสารตั้งต้นหรือสารตั้งต้นในการเกิดปฏิกิริยาเอนไซม์ โดยเฉพาะในการศึกษาที่เกี่ยวข้องกับไกลโคซิลทรานสเฟอเรส สารนี้มีบทบาทสำคัญในกระบวนการสังเคราะห์ทางชีวภาพของไกลโคคอนจูเกต เช่น ไกลโคโปรตีนและไกลโคลิปิด โดยทำหน้าที่เป็นผู้บริจาคโมเลกุลน้ำตาล สารประกอบนี้ยังถูกนำมาใช้ในการสังเคราะห์นิวคลีโอไทด์และกรดนิวคลีอิก ทำให้มีคุณค่าในสาขาชีววิทยาโมเลกุลและวิศวกรรมพันธุกรรม นอกจากนี้ ยังถูกใช้ในการศึกษาการเมแทบอลิซึมเพื่อตรวจสอบการเมแทบอลิซึมของคาร์โบไฮเดรตและเส้นทางนิวคลีโอไทด์น้ำตาล การประยุกต์ใช้นี้ขยายไปสู่การพัฒนายา โดยช่วยในการออกแบบและทดสอบตัวยับยั้งเอนไซม์ที่มุ่งเป้าไปยังกระบวนการไกลโคซิเลชัน