สารประกอบนี้ถูกใช้หลักๆ ในสาขาเคมีกรดนิวคลีอิกและชีววิทยาโมเลกุล โดยทำหน้าที่เป็นตัวกลางสำคัญในการสังเคราะห์นิวคลีโอไซด์ที่ถูกดัดแปลง ซึ่งจำเป็นสำหรับการพัฒนาโอลิโกนิวคลีโอไทด์ โอลิโกนิวคลีโอไทด์เหล่านี้ถูกนำไปใช้อย่างแพร่หลายในงานวิจัย เช่น การสังเคราะห์ยีน PCR และการจัดลำดับนิวคลีโอไทด์ กลุ่มปกป้องของสารประกอบ เช่น กลุ่ม bis(4-methoxyphenyl)(phenyl)methyl (DMT) ช่วยให้เกิดการถอดกลุ่มปกป้องแบบเลือกสรรในการสังเคราะห์แบบเฟสตะกอน ทำให้สามารถสร้างสาย DNA หรือ RNA ได้อย่างแม่นยำ การประยุกต์ใช้ของมันมีความสำคัญในการผลิตโอลิโกนิวคลีโอไทด์เพื่อการบำบัด รวมถึงยา antisense และ siRNA ซึ่งใช้ในการกำหนดเป้าหมายและปรับการแสดงออกของยีนในโรคต่างๆ นอกจากนี้ ยังมีประโยชน์ในการศึกษาอนาล็อกนิวคลีโอไทด์สำหรับการพัฒนายาต้านไวรัสหรือยารักษามะเร็ง