สารเคมีนี้ใช้หลักในการสังเคราะห์โอลิโกนิวคลีโอไทด์ โดยเฉพาะในสาขาการวิจัยทางพันธุกรรมและการพัฒนายา มันทำหน้าที่เป็นบล็อกโครงสร้างหลักในการสังเคราะห์แบบ solid-phase ของสาย DNA ที่ถูกดัดแปลง ซึ่งช่วยให้สามารถรวม difluoro-deoxycytidine เข้าสู่ลำดับโอลิโกนิวคลีโอไทด์ การดัดแปลงนี้ช่วยเพิ่มความเสถียรและความสามารถในการจับคู่ของ DNA ที่สังเคราะห์ขึ้น ทำให้มีคุณค่าต่อการประยุกต์ใช้ เช่น การบำบัดด้วย antisense การปิดยีน และการพัฒนาโปรบวินิจฉัย รูปแบบ phosphoramidite ของมันช่วยให้การคู่กันที่มีประสิทธิภาพและแม่นยำในระหว่างการสังเคราะห์ DNA แบบอัตโนมัติ ซึ่งรับประกันผลผลิตสูงและความถูกต้องในการผลิตโอลิโกนิวคลีโอไทด์ที่กำหนดเอง