สารนี้ใช้อย่างแพร่หลายในการสังเคราะห์โอลิโกนิวคลีโอไทด์ โดยทำหน้าที่เป็นส่วนประกอบหลักในการเตรียมลำดับ RNA ที่ถูกดัดแปลง การประยุกต์ใช้หลักอยู่ในกระบวนการสังเคราะห์แบบเฟสแข็งของ RNA สำหรับงานวิจัยและวัตถุประสงค์ทางรักษา โดยเฉพาะในการพัฒนาโอลิโกนิวคลีโอไทด์แบบแอนติเซนส์ siRNA และวัคซีน mRNA หมู่ปกป้องสไลิลและ DMT ช่วยให้เกิดปฏิกิริยาแบบเลือกเพศและประสิทธิภาพการจับคู่สูงในระหว่างการสังเคราะห์อัตโนมัติ ในขณะที่หมู่ฟอสโฟรอะไมไดต์ช่วยให้เกิดการสร้างพันธะฟอสโฟไดเอสเตอร์อย่างรวดเร็วและเชื่อถือได้ หมู่เทอร์ต-บิวทิลฟีโนกซีอะซิติลปกป้องเบสไซโตซีน ลดปฏิกิริยาไม่พึงประสงค์และเพิ่มผลผลิตโดยรวม สารนี้จำเป็นสำหรับการผลิต RNA ความบริสุทธิ์สูง โซ่ยาวพร้อมการดัดแปลงที่แม่นยำ ทำให้มีความสำคัญในด้านการพัฒนายาและการวิจัยชีววิทยาโมเลกุล