ใช้ในการสังเคราะห์โอลิโกนิวคลีโอไทด์แบบเฟสของแข็งเพื่อนำเสนอส่วนของอิโนซีนที่มีการเชื่อมโยงโครงสร้างหลังส่วนที่ดัดแปลงด้วยกำมะถัน อิโนซีนทำหน้าที่เป็นเบสสากลในการจับคู่ไฮบริดิเซชัน ซึ่งช่วยให้มีความยืดหยุ่นในการจับคู่กว้างขวางกับอะดีนีน ไซโตซีน และไทมีน ทำให้มีคุณค่าต่อการออกแบบโพรบแบบเสื่อม (degenerate probe) การตรวจหา SNP และการทดสอบ PCR แบบมัลติเพล็กซ์ การดัดแปลง 3'-thio ช่วยเพิ่มความต้านทานต่อนิวคลีเอสในโอลิโกนิวคลีโอไทด์ที่ได้สุดท้าย ซึ่งปรับปรุงความเสถียรสำหรับการใช้งานด้านการวินิจฉัยและบำบัด กลุ่ม DMT (dimethoxytrityl) ช่วยให้สามารถตรวจสอบประสิทธิภาพการจับคู่แบบเรียลไทม์ระหว่างการสังเคราะห์ กลุ่มฟอสฟอรัมมิดाइटช่วยให้ได้ผลผลิตการจับคู่สูงภายใต้สภาวะเครื่องสังเคราะห์ DNA มาตรฐาน นิยมใช้ในการพัฒนาโอลิโกนิวคลีโอไทด์แบบแอนติเซนส์ โมเลกุลบีคอน และไพรเมอร์สำหรับเทมเพลตที่ท้าทายซึ่งการจับคู่แบบว็อบเบิลมีประโยชน์