N6-Acetyl-2'-deoxyadenosine ถูกใช้หลักในการวิจัยทางชีวเคมี โดยเฉพาะในการศึกษากลไกการซ่อมแซมดีเอ็นเอและการเผาผลาญนิวคลีโอไซด์ มันทำหน้าที่เป็นนิวคลีโอไซด์ที่ถูกดัดแปลง ช่วยให้นักวิทยาศาสตร์เข้าใจว่าการเปลี่ยนแปลงในเบสของดีเอ็นเอส่งผลต่อกระบวนการในเซลล์อย่างไร สารประกอบนี้ยังถูกนำมาใช้ในการพัฒนานิวคลีโอไทด์อะนาล็อกสำหรับการประยุกต์ใช้ทางยารักษา เช่น ยาต้านไวรัสหรือยารักษามะเร็ง นอกจากนี้ยังมีบทบาทในการตรวจสอบความจำเพาะและกิจกรรมของเอนไซม์ในชีวเคมีกรดนิวคลีอิก กลุ่มอะซิทิลของมันทำให้เป็นเครื่องมือที่มีคุณค่าในการสำรวจพลวัตโครงสร้างและหน้าที่ของดีเอ็นเอและการโต้ตอบกับโปรตีน