ใช้ในการสังเคราะห์ oligonucleotide ซึ่งเป็นกระบวนการสำคัญในการวิจัยทางชีววิทยาโมเลกุลและเทคโนโลยีชีวภาพ โดยสารนี้ทำหน้าที่เป็นหน่วยโครงสร้างของ 5-เมทิล-2'-เดอออกซีไซติดีน ที่ได้รับการป้องกันในการสร้างสาย DNA ในเครื่องสังเคราะห์ oligonucleotide แบบอัตโนมัติ กลุ่มป้องกัน dimethoxytrityl (DMT) ช่วยในการควบคุมและตรวจสอบขั้นตอนการสังเคราะห์ ในขณะที่กลุ่ม isobutyryl ปกป้องกลุ่มเอมีนของ 5-เมทิลไซโตซีนเพื่อป้องกันปฏิกิริยาที่ไม่ต้องการ สารนี้มีความสำคัญในการผลิต probes, primers และสารตั้งต้นสำหรับการจัดลำดับ DNA และการวิเคราะห์ทางพันธุกรรม