ใช้หลักในการวิจัยเป็นตัวตรวจสอบฟลูออเรสเซนต์สำหรับกรดนิวคลีอิก โดยเฉพาะดีเอ็นเอและอาร์เอ็นเอ โครงสร้างแกนอะคริดีนช่วยให้สามารถแทรกตัวระหว่างคู่เบส ทำให้มีประสิทธิภาพในการย้อมสีและแสดงภาพวัสดุทางพันธุกรรมภายใต้กล้องจุลทรรศน์ฟลูออเรสเซนต์ นิยมใช้ในเซลล์พันธุศาสตร์สำหรับการศึกษาแบนด์โครโมโซมและในงานทดลองชีววิทยาโมเลกุลเพื่อตรวจสอบปฏิกิริยาของกรดนิวคลีอิก นอกจากนี้ยังมีการศึกษาความเป็นไปได้ในการบำบัดด้วยแสงไดนามิกเนื่องจากผลกระทบต่อเซลล์มะเร็งที่เป็นพิษเมื่อถูกแสงกระตุ้น แสดงกิจกรรมต้านจุลินทรีย์ในบางการศึกษา แม้จะไม่ใช้ในทางคลินิก จำกัดการใช้หลักในห้องปฏิบัติการสำหรับการถ่ายภาพและการศึกษา การจับติด