IR-786 เปอร์คลอเรต ใช้เป็นสีย้อมเรืองแสงใกล้อินฟราเรด (NIR) ในงานการถ่ายภาพทางชีวภาพและการถ่ายภาพทางแสง สามารถดูดกลืนและปล่อยแสงในช่วง NIR ได้ดี ทำให้เหมาะสำหรับการถ่ายภาพเนื้อเยื่อลึก ซึ่งช่วยให้เห็นโครงสร้างทางชีวภาพโดยมีการรบกวนจาก autofluorescence พื้นหลังน้อย

มักใช้ในการถ่ายภาพมะเร็งและตรวจจับเนื้องอก เนื่องจากสามารถสะสมในเนื้อเยื่อมะเร็งได้ นอกจากนี้ยังใช้ในโฟโตเทอร์มัลเทอราพีและเป็น photosensitizer ร่วมกับการฉายเลเซอร์เพื่อสร้างความร้อนในการทำลายเซลล์เป้าหมาย

นำไปใช้ในการพัฒนาเซลล์แสงอาทิตย์ออร์แกนิกและอุปกรณ์อิเล็กทรอนิกส์แสงเนื่องจากคุณสมบัติการเก็บเกี่ยวแสงที่ยอดเยี่ยม

มักรวมเข้ากับนาโนอนุภาคหรือไลโปโซมเพื่อเพิ่มความเสถียรและความจำเพาะเจาะจงในการใช้งานในร่างกาย

นอกจากนี้ ยังใช้เป็นสารติดตามหรือสารให้แสงในระบบการถ่ายภาพทางชีวภาพ เช่น การถ่ายภาพเนื้อเยื่อหรือการติดตามเซลล์ในสัตว์ทดลอง เนื่องจากแสง NIR แทรกซึมผ่านเนื้อเยื่อได้ดีและรบกวนพื้นหลังต่ำ

ใช้ในอุปกรณ์อิเล็กทรอนิกส์ออร์แกนิก เช่น โฟโตไดโอดหรือเซลล์แสงอาทิตย์ที่ไวต่อ NIR โดยทำหน้าที่เป็นตัวดูดกลืนแสงหรือตัวนำประจุ

ยังถูกใช้ในการวิจัยวัสดุเซ็นเซอร์ เนื่องจากสามารถตอบสนองต่อการเปลี่ยนแปลงของสภาพแวดล้อม เช่น อุณหภูมิหรือความดัน ผ่านการเปลี่ยนแปลงของสเปกตรัมการเรืองแสง

อย่างไรก็ตาม สารนี้มีความเสถียรต่ำเมื่อสัมผัสกับแสงและอากาศ จึงจำเป็นต้องเก็บรักษาและใช้งานในสภาพแวดล้อมที่ควบคุมอย่างเหมาะสม