ML-346 ถูกใช้เป็นสารยับยั้งการทำงานของโปรตีนเฉพาะชนิดที่เกี่ยวข้องกับกระบวนการอักเสบและโรคทางระบบประสาท โดยมีเป้าหมายหลักคือการลดการอักเสบที่เกิดขึ้นในสมอง ซึ่งอาจช่วยชะลอการเสื่อมของเซลล์ประสาทในโรคทางระบบประสาท เช่น โรคอัลไซเมอร์หรือโรคฮันติงตัน สารนี้จึงถูกศึกษาในงานวิจัยด้านชีวเคมีเพื่อประเมินศักยภาพในการพัฒนาเป็นยารักษาโรคที่เกี่ยวข้องกับการอักเสบเรื้อรังในระบบประสาทส่วนกลาง นอกจากนี้ยังใช้เป็นเครื่องมือในการศึกษาโมเลกุลกลไกของเส้นทางสัญญาณภายในเซลล์ โดยเฉพาะในโมเดลเซลล์หรือสัตว์ทดลองเพื่อทำความเข้าใจบทบาทของโปรตีนเป้าหมายในสภาวะทางพยาธิวิทยาต่าง ๆ