Epothilone B ถูกนำมาใช้ในการรักษาโรคมะเร็ง โดยเฉพาะมะเร็งที่ดื้อต่อเคมีบำบัดแบบเดิม มันทำงานโดยการยับยั้งการแบ่งตัวของเซลล์มะเร็งผ่านการจับกับไมโครทิวบูล ทำให้เซลล์ไม่สามารถแบ่งตัวและเจริญเติบโตได้ นอกจากนี้ยังมีการศึกษาที่แสดงให้เห็นว่ามันมีประสิทธิภาพในการรักษามะเร็งเต้านม มะเร็งปอด และมะเร็งลำไส้ใหญ่ เนื่องจากกลไกการออกฤทธิ์ที่แตกต่างจากยาเคมีบำบัดทั่วไป ทำให้ Epothilone B เป็นทางเลือกสำหรับผู้ป่วยที่ดื้อต่อการรักษาแบบเดิม