ใช้ในระบบส่งยาอย่างแม่นยำ เนื่องจากมีคุณสมบัติแม่เหล็ก สามารถควบคุมการเคลื่อนที่ด้วยสนามแม่เหล็กภายนอก ทำให้ส่งยาไปยังตำแหน่งเป้าหมายในร่างกายได้อย่างมีประสิทธิภาพ ช่วยลดผลข้างเคียงต่อเนื้อเยื่อปกติ นิยมใช้ในการแยกสารชีวโมเลกุล เช่น การแยกโปรตีนหรือดีเอ็นเอ โดยการเคลือบพื้นผิวไมโครสเฟียร์ด้วยสารที่จับเฉพาะเจาะจง แล้วใช้สนามแม่เหล็กดึงสารเป้าหมายออกมาจากสารละลาย เหมาะสำหรับการตรวจวิเคราะห์ทางชีวภาพ เช่น การตรวจหาเชื้อโรคหรือสารชีวภาพในตัวอย่างชีวภาพ เพราะสามารถทำให้เกิดสัญญาณได้ชัดเจนและแยกตัวอย่างได้ง่าย ยังนำไปใช้ในกระบวนการบำบัดน้ำเสีย โดยดูดซับโลหะหนักหรือสารอินทรีย์พิษ แล้วใช้สนามแม่เหล็กดึงไมโครสเฟียร์พร้อมสารปนเปื้อนออกมารีไซเคิลหรือกำจัดได้สะดวก