N-(2-Aminoethyl)isoquinoline-5-sulfonamide hydrochloride ถูกใช้หลักในการวิจัยทางชีวเคมีในฐานะตัวยับยั้งโปรตีนไคเนสที่มีประสิทธิภาพสูง มีบทบาทสำคัญในการศึกษากลไกการส่งสัญญาณในเซลล์ โดยเฉพาะอย่างยิ่งที่เกี่ยวข้องกับ calcium/calmodulin-dependent protein kinase II (CaMKII) สารประกอบนี้ถูกนำมาใช้ในการตรวจสอบกลไกการทำงานของไคเนสและผลกระทบต่อกระบวนการทางสรีรวิทยาและพยาธิสรีรวิทยาต่าง ๆ เช่น หน้าที่ของเซลล์ประสาท การควบคุมหัวใจ และการก่อตัวของความทรงจำ นอกจากนี้ยังเป็นเครื่องมือที่มีคุณค่าในการค้นคว้าและพัฒนายา ช่วยในการระบุเป้าหมายบำบัดที่เป็นไปได้สำหรับโรคที่เกี่ยวข้องกับการควบคุมไคเนสที่ผิดปกติ รวมถึงมะเร็ง โรคเสื่อมถอยของระบบประสาท และภาวะหัวใจและหลอดเลือด การประยุกต์ใช้ขยายไปถึงการศึกษานอกเซลล์และในร่างกาย ให้ข้อมูลเชิงลึกเกี่ยวกับการปรับเปลี่ยนเส้นทางการไคเนสที่เกี่ยวข้องและผลกระทบต่อพฤติกรรมของเซลล์