DEAE-Sephadex ถูกใช้อย่างแพร่หลายในชีวเคมีและชีววิทยาโมเลกุลสำหรับการแยกและทำให้บริสุทธิ์ชีวโมเลกุล โดยเฉพาะโปรตีนและกรดนิวคลีอิก คุณสมบัติแลกเปลี่ยนไอออนแบบแอนไอออนทำให้มีประสิทธิภาพในการจับโมเลกุลที่มีประจุลบ เช่น DNA, RNA และโปรตีนที่มีจุดไอโซอิเล็กทริกต่ำ ช่วยให้สามารถแยกจากส่วนผสมที่ซับซ้อนได้ มักใช้ในโครมาโทกราฟีแบบคอลัมน์ ซึ่งช่วยแยกโปรตีนตามความแตกต่างของประจุ DEAE-Sephadex ยังนำไปใช้ในการทำให้บริสุทธิ์เอนไซม์ แอนติบอดี และสารประกอบชีวภาพอื่นๆ ที่มีกิจกรรมทางชีวภาพ นอกจากนี้ ยังประยุกต์ใช้ในกระบวนการกำจัดเกลือ เพื่อขจัดเกลือและโมเลกุลขนาดเล็กอื่นๆ จากสารละลายโปรตีน ความหลากหลายและใช้งานง่ายทำให้เป็นเครื่องมือที่มีคุณค่าในห้องปฏิบัติการวิจัยและการผลิตอุตสาหกรรมสำหรับการแปรรูปขั้นปลายและการวิเคราะห์