DEAE–Sepharose ใช้กันอย่างแพร่หลายในการโครมาโตกราฟีสำหรับการทำให้บริสุทธิ์โปรตีน กรดนิวคลีอิก และชีวโมเลกุลอื่นๆ คุณสมบัติการแลกเปลี่ยนไอออนแบบแอนไอออนทำให้มีประสิทธิภาพในการแยกโมเลกุลตามประจุของพวกเขา มักใช้ในการแยกเอนไซม์ แอนติบอดี และโปรตีนพลาสมาในการวิจัยทางชีวเคมีและชีวเภสัชภัณฑ์ เมทริกซ์นี้ยังใช้ในการกำจัดสารปนเปื้อนในกระบวนการหลังการผลิต ความจุสูงและความเสถียรทำให้เหมาะสำหรับการใช้งานทั้งในระดับห้องปฏิบัติการและอุตสาหกรรม นอกจากนี้ DEAE–Sepharose ยังใช้ในการแยกส่วนของตัวอย่างชีวภาพที่ซับซ้อน เพื่อช่วยในการศึกษาการโต้ตอบและหน้าที่ของโมเลกุล