เมทิล 5-ไอโอโด-1H-อินโดล-3-คาร์บ็อกซิเลต ใช้หลักในการสังเคราะห์อินทรีย์เป็นสารตั้งต้นสำคัญสำหรับการเตรียมอนุพันธ์อินโดลต่าง ๆ อนุพันธ์เหล่านี้มีคุณค่าในงานวิจัยเภสัชกรรม โดยเฉพาะในการพัฒนาสารประกอบที่มีกิจกรรมทางชีวภาพ tiềm năng เช่น สารต้านมะเร็ง ต้านไวรัส และต้านการอักเสบ หมู่ไอโอดีนที่ตำแหน่ง 5 ทำให้เป็นบล็อกก่อสร้างที่หลากหลายสำหรับการปรับแต่งเพิ่มเติมผ่านปฏิกิริยาการจับคู่ข้าม เช่น Suzuki หรือ Sonogashira couplings ซึ่งช่วยในการสร้างโมเลกุลที่ซับซ้อน นอกจากนี้ยังใช้ในการสังเคราะห์อนุพันธ์ผลิตภัณฑ์ธรรมชาติและสารชีวภาพที่มีกิจกรรม สนับสนุนการค้นพบยาและความพยายามในเคมียารักษา บทบาทของมันในการสร้างกรอบโครงสร้างฐานอินโดลมีความสำคัญต่อการสำรวจตัวแทนบำบัดใหม่