5-Hydroxyindole-2-carboxylic acid ถูกใช้หลักในการวิจัยทางชีวเคมีและการพัฒนายาเภสัชกรรม โดยทำหน้าที่เป็นสารตั้งต้นสำคัญในการสังเคราะห์สารประกอบที่มีกิจกรรมทางชีวภาพหลากหลาย รวมถึงสารที่มีศักยภาพในการรักษา สารเคมีนี้มักถูกนำมาใช้ในการศึกษากลไกทางเดินของเซโรโทนินและกระบวนการทางระบบประสาทที่เกี่ยวข้อง เพื่อช่วยในการพัฒนายาเป้าหมายสำหรับโรคสุขภาพจิต เช่น ซึมเศร้าและวิตกกังวล นอกจากนี้ ยังใช้ในการเตรียมอนุพันธ์อินโดล ซึ่งถูกสำรวจสำหรับคุณสมบัติต้านอนุมูลอิสระ ต้านการอักเสบ และต้านมะเร็ง บทบาทของมันในการสังเคราะห์อินทรีย์ยังขยายไปถึงการสร้างโมเลกุลซับซ้อนสำหรับเคมียารักษาและการค้นพบยา