สารละลายอัลซาริน เรด เอส ใช้เป็นตัวบ่งชี้ในการตรวจจับไอออนโลหะบางชนิด โดยเฉพาะแคลเซียม (Ca²⁺) ในตัวอย่างชีวภาพและสารละลายทางเคมี นิยมใช้ในห้องปฏิบัติการชีววิทยาและชีวเคมีเพื่อการย้อมสีเนื้อเยื่อ เช่น การตรวจสอบการสะสมของแคลเซียมในเนื้อเยื่อกระดูกหรือเนื้อเยื่อที่มีการแคลเซียมสะสมผิดปกติ ยังใช้ในงานวิจัยด้านการพัฒนากระดูกและการศึกษาโรคที่เกี่ยวข้องกับการเผาผลาญของแคลเซียม นอกจากนี้ยังสามารถใช้เป็นตัวบ่งชี้ในปฏิกิริยาไทเทรตแบบคอมเพล็กซ์ (complexometric titration) สำหรับการวิเคราะห์ปริมาณโลหะหนักในตัวอย่างน้ำหรือสิ่งแวดล้อม