สารละลายอัลิซารินเรด เอสดูดซับกับแคลเซียมไอออนได้ดี จึงถูกใช้อย่างแพร่หลายในการตรวจหาและย้อมแคลเซียมในเนื้อเยื่อทางชีววิทยา โดยเฉพาะในงานวิจัยกระดูกและฟัน ช่วยให้เห็นการตกตะกอนของแร่ธาตุหรือการแคลเซียมสะสมในเนื้อเยื่ออย่างชัดเจนภายใต้กล้องจุลทรรศน์ นอกจากนี้ยังใช้ในห้องปฏิบัติการเพื่อประเมินการสร้างกระดูกจากเซลล์ต้นกำเนิดหรือเซลล์ที่มีศักยภาพในการสร้างกระดูก รวมถึงใช้เป็นตัวบ่งชี้ในกระบวนการวิเคราะห์เชิงปริมาณของแคลเซียมในตัวอย่างชีวภาพบางชนิด