ใช้โซเดียมอะซิเตตบัฟเฟอร์ในห้องปฏิบัติการชีววิทยาโมเลกุลเพื่อรักษาค่าความเป็นกรด-ด่าง (pH) ให้คงที่ในช่วงที่เหมาะสม โดยเฉพาะในกระบวนการแยกสารโปรตีนหรือกรดนิวคลีอิก เช่น การทำ PCR หรือการแยกดีเอ็นเอด้วยเจล อีเล็กโทรโฟรีซิส ช่วยให้ปฏิกิริยาทางชีวเคมีเกิดขึ้นอย่างมีประสิทธิภาพและเสถียร บัฟเฟอร์ชนิดนี้ยังใช้ในอุตสาหกรรมยาและอาหารเพื่อควบคุมความเป็นกรด และบางครั้งใช้เป็นสารกันเสียหรือตัวปรับรสในผลิตภัณฑ์อาหาร