BIX-01294 ถูกใช้ในการวิจัยทางวิทยาศาสตร์เพื่อศึกษากลไกการทำงานของเอนไซม์ histone methyltransferases (HMTs) ซึ่งเกี่ยวข้องกับการควบคุมการแสดงออกของยีน โดยเฉพาะในกระบวนการ epigenetic modification มันถูกนำมาใช้เป็นสารยับยั้งเฉพาะเจาะจงสำหรับ G9a histone methyltransferase ซึ่งมีบทบาทสำคัญในการควบคุมการทำงานของยีนและการพัฒนาของเซลล์ ในห้องปฏิบัติการ BIX-01294 มักถูกใช้เพื่อศึกษาผลกระทบของการยับยั้ง G9a ต่อการเปลี่ยนแปลงทาง epigenetic และการแสดงออกของยีนในเซลล์มะเร็ง เซลล์ต้นกำเนิด และเซลล์อื่นๆ นอกจากนี้ยังมีการศึกษาเพื่อประเมินศักยภาพในการรักษาโรคที่เกี่ยวข้องกับการผิดปกติของ epigenetic เช่น มะเร็งและโรคทางระบบประสาท