EHMT2-IN-2 ถูกนำมาใช้หลักๆ ในงานวิจัยเพื่อศึกษาบทบาทของ EHMT2 (หรือที่รู้จักในชื่อ G9a) ในการควบคุม epigenetic มันทำหน้าที่เป็นตัวยับยั้ง EHMT2 ที่มีประสิทธิภาพสูงและเลือกสรร โดย EHMT2 เป็นเอนไซม์ที่เกี่ยวข้องกับการเมทิลเลชันของฮิสโตน H3 ซึ่งมีบทบาทสำคัญในการแสดงออกของยีนและการปรับโครงสร้างโครมาติน นักวิจัยใช้ EHMT2-IN-2 เพื่อตรวจสอบผลกระทบต่อการเพิ่มจำนวนเซลล์มะเร็ง เนื่องจาก EHMT2 มักถูกแสดงออกมากเกินไปในมะเร็งหลายชนิดและมีส่วนในการเจริญเติบโตของเนื้องอกและการแพร่กระจาย นอกจากนี้ สารนี้ยังถูกนำมาใช้ในการศึกษาความเป็นไปได้ในการย้อนกลับการปิดกั้นการแสดงออกของยีนที่ผิดปกติ ซึ่งอาจมีนัยสำคัญในการพัฒนาการบำบัดสำหรับโรคที่เกี่ยวข้องกับการควบคุม epigenetic ที่ผิดปกติ เช่น โรคทางระบบประสาทและมะเร็งบางชนิด การประยุกต์ใช้ยังขยายไปถึงการทำความเข้าใจการแยกตัวของเซลล์และบทบาทของการเมทิลเลชันฮิสโตนในชีววิทยาของสเต็มเซลล์