อะโซคาร์มีน จี ใช้หลักๆ เป็นสีย้อมทางชีวภาพในฮิสโทโลยีและจุลทรรศนีศาสตร์ มีประสิทธิภาพโดยเฉพาะในการย้อมส่วนประกอบเนื้อเยื่อที่เป็นกรด เช่น ไซโทพลาซึมและคอลลาเจน ทำให้เป็นเครื่องมือที่มีค่าในการแยกแยะโครงสร้างเซลล์ภายใต้กล้องจุลทรรศน์ สีย้อมนี้มักใช้ร่วมกับสีย้อมอื่นๆ เพื่อเพิ่มความเปรียบต่างและให้การมองเห็นเนื้อเยื่อที่ชัดเจนยิ่งขึ้น นอกจากนี้ อะโซคาร์มีน จี ยังใช้ในเทคนิคการย้อมสีเฉพาะทางบางอย่างเพื่อศึกษาประเภทเนื้อเยื่อเฉพาะหรือภาวะทางพยาธิวิทยา ช่วยในการวินิจฉัยและการประยุกต์ใช้การวิจัย สีสันสดใสและคุณสมบัติการย้อมทำให้เป็นตัวเลือกที่เชื่อถือได้สำหรับการวิเคราะห์ทางจุลทรรศน์โดยละเอียดในการศึกษาชีวภาพและการแพทย์