Chromotrope 2R ใช้กันอย่างแพร่หลายเป็นสีย้อมทางชีวภาพในฮิสโตโลจีและจุลทรรศน์ โดยเฉพาะอย่างยิ่งมีประสิทธิภาพในการย้อมเนื้อเยื่อเกี่ยวพัน คอลลาเจน และ mucopolysaccharides ทำให้สามารถมองเห็นได้ชัดเจนภายใต้กล้องจุลทรรศน์ ในด้านการวินิจฉัยทางการแพทย์ ช่วยในการระบุโครงสร้างเนื้อเยื่อที่ผิดปกติ ทำให้มีคุณค่าในการศึกษาทางพยาธิวิทยา นอกจากนี้ ยังใช้ในอุตสาหกรรมสิ่งทอเป็นสีย้อมกรดสำหรับย้อมขนสัตว์ ผ้าไหม และไนลอน ให้สีที่สดใสและทนทาน การประยุกต์ใช้ยังขยายไปถึงตัวบ่งชี้ pH ในขั้นตอนการวิเคราะห์บางอย่าง ซึ่งช่วยในการกำหนดความเป็นกรดหรือด่างตามการเปลี่ยนแปลงสี