ใช้เป็นสารตั้งต้นในการสังเคราะห์สารประกอบอินดาโซลที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพ โดยเฉพาะในงานวิจัยด้านเภสัชกรรมเพื่อพัฒนายาที่มีเป้าหมายไปยังตัวรับหรือเอนไซม์เฉพาะเจาะจง เช่น ยาต้านมะเร็ง หรือยาแก้อักเสบ โครงสร้างที่มีหมู่บราวีนและไอโอดีนทำให้สามารถทำปฏิกิริยาต่อได้หลากหลาย เช่น การทำปฏิกิริยาแทนที่ของนิวคลีโอไฟล์หรือปฏิกิริยาข้ามพันธะแบบพาลลาเดียม-แมกนีเซียม ซึ่งเหมาะสำหรับการสร้างสารอนุพันธ์จำนวนมากในขั้นตอนการคัดกรองทางชีวภาพ หมู่ซิลิลเอเทอร์ทำหน้าที่เป็นหมู่ป้องกันที่เสถียรและสามารถกำจัดได้ง่ายภายใต้สภาวะกรดอ่อน ทำให้ควบคุมการสังเคราะห์ขั้นตอนได้อย่างแม่นยำ