Deschloroclozapine ใช้หลักๆ ในงานวิจัย โดยเฉพาะในสาขาประสาทวิทยาและเภสัชวิทยา เป็นสารสำคัญในการศึกษากิจกรรมของตัวรับและเส้นทางส่งสัญญาณ มักใช้เป็นสารควบคุมหรือสารอ้างอิงในงานทดลองที่เกี่ยวข้องกับอนุพันธ์ของ clozapine การประยุกต์ใช้มีความสำคัญในการทำความเข้าใจผลเภสัชวิทยาและกลไกการออกฤทธิ์ของสารที่เกี่ยวข้อง ช่วยในการพัฒนายาตัวใหม่สำหรับโรคทางจิตเวชและระบบประสาท นอกจากนี้ยังใช้ในการออกแบบและทดสอบเครื่องมือเคมีพันธุกรรม เช่น Designer Receptors Exclusively Activated by Designer Drugs (DREADDs) เพื่อศึกษาระบบประสาทและการทำงานของสมองด้วยความแม่นยำสูง