ใช้หลักๆ เป็นสารกลางสำคัญในการสังเคราะห์ยาและสารเคมีเกษตร หมู่ซัลโฟนิลคลอไรด์ทำปฏิกิริยากับนิวคลีโอไฟล์ เช่น อะมีนและแอลกอฮอล์ ได้อย่างง่ายดาย ทำให้มีคุณค่าต่อการสร้างอนุพันธ์ซัลโฟนาไมด์และเอสเตอร์ซัลโฟเนต หมู่อาร์คติวเหล่านี้พบทั่วไปในโมเลกุลชีวภาพที่ออกฤทธิ์ รวมถึงยารักษาเบาหวาน ยาต้านไวรัส และยาต้านการอักเสบ หมู่ไตรฟลูออโรมิทิลที่ดูดอิเล็กตรอนช่วยเพิ่มความเสถียรทางเมแทบอลิซึมและลิโพฟิลิก ซึ่งปรับปรุงการซึมผ่านเยื่อหุ้มเซลล์ในยาที่เป็นผู้สมัคร นอกจากนี้ยังใช้ในการพัฒนายาฆ่าหญ้าและยาฆ่าแมลง เนื่องจากโครงสร้าง trifluoromethylbenzyl ที่ให้ความเสถียรและโปรไฟล์ปฏิกิริยา ใช้ทั่วไปในเคมียารักษาเพื่อการฟังก์ชันนาไลเซชันระยะหลังและการสังเคราะห์ไลบรารีในโปรแกรมค้นพบยา