ใช้เป็นสารเคมีกลางสำคัญในการสังเคราะห์ยาฟลูออรีน โดยเฉพาะในการพัฒนายาต้านการอักเสบที่ไม่ใช่สเตียรอยด์ (NSAIDs) และตัวยับยั้ง COX-2 แบบเลือกเพศ โครงสร้างของมันช่วยเพิ่มความเสถียรทางเมแทบอลิซึมและความสัมพันธ์ในการจับกับโมเลกุลยา นอกจากนี้ยังใช้ในสารเคมีเกษตรเพื่อสร้างสารกำจัดวัชพืชและยาฆ่าเชื้อรา โดยลวดลายฮาโลเจนช่วยปรับปรุงการดูดซึมทางชีวภาพและความจำเพาะต่อเป้าหมาย นิยมใช้ในเคมียารักษาโรคสำหรับการศึกษาความสัมพันธ์โครงสร้าง-กิจกรรม (SAR) เนื่องจากคุณสมบัติดึงอิเล็กตรอนและความสามารถในการอิทธิพลรูปร่างโมเลกุล นอกจากนี้ยังนิยมใช้ในงานวิจัยและพัฒนายาใหม่ เนื่องจากหมู่ฟลูออรีนและคลอรีนช่วยเพิ่มความสามารถในการผ่านเยื่อหุ้มเซลล์และเพิ่มความจำเพาะต่อเป้าหมายทางชีวภาพ และใช้เป็นรีเอเจนต์ในปฏิกิริยาแทนที่ของนิวคลีโอไฟล์ในสังเคราะห์อินทรีย์