3,4,5,6-เทตระฟลูออโรเบนซีน-1,2-ไดออล ใช้หลักในการสังเคราะห์สารประกอบอินทรีย์ที่ซับซ้อน โดยเฉพาะในอุตสาหกรรมเภสัชกรรมและเกษตรเคมี โครงสร้างฟลูออรีนของมันทำให้เป็นสารตั้งต้นที่มีคุณค่าสำหรับการพัฒนาโมเลกุลที่มีกิจกรรมทางชีวภาพและความเสถียรที่เพิ่มขึ้น

ในเภสัชกรรม มันทำหน้าที่เป็นส่วนประกอบพื้นฐานในการสร้างยาที่มีคุณสมบัติต้านการเผาผลาญและการดูดซึมทางชีวภาพที่ดีขึ้น โดยมักกำหนดเป้าหมายไปที่เอนไซม์หรือตัวรับเฉพาะ ในเกษตรเคมี ใช้ในการออกแบบยาฆ่าแมลงและสารกำจัดวัชพืชที่มีประสิทธิภาพสูงขึ้นและผลกระทบต่อสิ่งแวดล้อมต่ำลง

นอกจากนี้ คุณสมบัติทางเคมีที่เป็นเอกลักษณ์ทำให้เหมาะสำหรับใช้ในวิทยาศาสตร์วัสดุ โดยสามารถนำไปรวมในโพลิเมอร์หรือสารเคลือบเพื่อมอบลักษณะเฉพาะ เช่น การกันน้ำหรือความต้านทานต่อสารเคมี ความหลากหลายและปฏิกิริยาของมันทำให้เป็นส่วนประกอบสำคัญในงานวิจัยทางเคมีขั้นสูงและการประยุกต์ใช้ในอุตสาหกรรม