5-Fluoropentan-1-ol ถูกนำมาใช้เป็นหลักในการสังเคราะห์อินทรีย์ในฐานะสารตั้งต้นสำหรับการผลิตสารประกอบเคมีที่ซับซ้อนมากขึ้น อะตอมฟลูออรีนของมันทำให้เป็นสารกลางที่มีคุณค่าต่อการพัฒนายา โดยเฉพาะในการสร้างยาที่ต้องการโครงสร้างฟลูออรีนเพื่อเพิ่มกิจกรรมทางชีวภาพหรือความเสถียร นอกจากนี้ ยังถูกใช้ในการสังเคราะห์สารเคมีเกษตร ซึ่งการนำฟลูออรีนเข้ามาสามารถปรับปรุงประสิทธิภาพและความเลือกเฉพาะของยาฆ่าแมลงหรือสารกำจัดวัชพืช กลุ่มฮีดรอกซิลของสารนี้ยังช่วยให้สามารถปรับแต่งเพิ่มเติมได้ ทำให้มีความยืดหยุ่นในปฏิกิริยาเคมีต่างๆ รวมถึงเอสเทอร์และเอเทอร์ นักวิจัยมักใช้ในการศึกษาวิทยาศาสตร์ฟลูออรีนเพื่อสำรวจเส้นทางปฏิกิริยาใหม่และพัฒนาวัสดุฟลูออรีนใหม่