น้ำมันหอมระเหยจากหัวหอมใช้ในการควบคุมศัตรูพืชแบบธรรมชาติ เนื่องจากกลิ่นแรงและสารประกอบกำมะถันที่ไล่แมลง เช่น เพลี้ยและไร มักเติมลงในสเปรย์กำจัดแมลงอินทรีย์เพื่อปกป้องพืชผล

นำมาใช้ในอโรมาเธอราพีเพื่อคุณสมบัติต้านจุลินทรีย์ ช่วยลดแบคทีเรียในอากาศภายในอาคาร

ใช้ในปริมาณน้อยสำหรับการถนอมอาหารด้วยผลต้านอนุมูลอิสระที่ช่วยยืดอายุการเก็บรักษาสินค้าที่เน่าเสียง่าย และเป็นสารแต่งกลิ่นในผลิตภัณฑ์อาหารและเครื่องดื่ม เพื่อให้กลิ่นหอมเฉพาะตัวของหัวหอม แต่ต้องใช้ในปริมาณน้อยเพราะกลิ่นแรง

พบในสูตรเครื่องสำอางและผลิตภัณฑ์ดูแลผิวหนังเพื่อประโยชน์ต้านการอักเสบและต้านเชื้อแบคทีเรีย โดยเฉพาะในผลิตภัณฑ์สำหรับผิวเป็นสิว การรักษาแผล และลดอาการอักเสบของผิว เช่น แผลเป็นนูนหรือแผลจากอุบัติเหตุ

นอกจากนี้ยังใช้ในผลิตภัณฑ์ดูแลเส้นผม โดยเฉพาะสูตรที่ช่วยกระตุ้นการเจริญเติบโตของเส้นผม ลดการหลุดร่วง และกระตุ้นการไหลเวียนเลือดที่หนังศีรษะจากสารบางชนิด

มีการศึกษาวิจัยเกี่ยวกับการใช้น้ำมันหัวหอมในผลิตภัณฑ์สมุนไพรเพื่อส่งเสริมสุขภาพ เช่น ช่วยลดระดับคอเลสเตอรอลและสนับสนุนระบบภูมิคุ้มกัน แต่ยังต้องการงานวิจัยเพิ่มเติมเพื่อยืนยันประสิทธิภาพ