Zebularine ใช้หลักในการวิจัยด้าน epigenetics เนื่องจากสามารถยับยั้ง DNA methyltransferases ซึ่งเป็นเอนไซม์ที่เพิ่มกลุ่มเมทิลให้กับ DNA การยับยั้งนี้ทำให้เกิดการ reactivate ของยีนที่ถูกปิดการทำงานโดยการเมทิลเลชัน ทำให้เป็นเครื่องมือที่มีคุณค่าในการศึกษาการแสดงออกของยีนและการควบคุมทาง epigenetics ในการวิจัยมะเร็ง Zebularine ถูกศึกษาสำหรับศักยภาพในการย้อนกลับรูปแบบการเมทิลเลชัน DNA ที่ผิดปกติ ซึ่งมักเกี่ยวข้องกับการปิดการทำงานของยีนยับยั้งเนื้องอก โดยการกำจัดเมทิลและ reactivate ยีนเหล่านี้ อาจช่วยฟื้นฟูการทำงานปกติของเซลล์และยับยั้งการเจริญเติบโตของเนื้องอก นอกจากนี้ Zebularine ยังถูกสำรวจในการพัฒนาการบำบัดทาง epigenetics สำหรับโรคต่างๆ รวมถึงโรคทางระบบประสาทและโรคภูมิต้านทานตัวเอง ซึ่งการเมทิลเลชัน DNA ผิดปกติมีบทบาท การประยุกต์ใช้ขยายไปถึงการวิจัยเกษตรกรรม โดยใช้ในการศึกษา epigenetic modifications ในพืช ซึ่งอาจปรับปรุงลักษณะพืชและความต้านทานต่อความเครียด นอกจากนี้ยังใช้ในห้องปฏิบัติการเพื่อศึกษากระบวนการ reprogramming ของเซลล์และการฟื้นฟูการทำงานของยีนที่ถูกปิดกั้น