FLI-06 ถูกนำมาใช้หลักๆ ในการวิจัยทางชีวเคมีและเภสัชวิทยา เนื่องจากมีความสามารถในการยับยั้งการหลั่งโปรตีน โดยเฉพาะอย่างยิ่งมีคุณค่าในการศึกษาที่มุ่งเน้นไปที่ Golgi apparatus เนื่องจากมันรบกวนการทำงานของออร์แกเนลล์นี้ ทำให้ได้ข้อมูลเชิงลึกเกี่ยวกับกลไกการขนส่งและการประมวลผลโปรตีน นักวิจัยใช้ FLI-06 เพื่อตรวจสอบเส้นทางในเซลล์และบทบาทของกระบวนการหลั่งในสภาวะทางสรีรวิทยาและพยาธิสรีรวิทยาต่างๆ การประยุกต์ใช้ขยายไปถึงการวิจัยมะเร็ง ซึ่งช่วยในการทำความเข้าใจบทบาทของการหลั่งโปรตีนในการเจริญเติบโตของเนื้องอกและการแพร่กระจาย นอกจากนี้ FLI-06 ยังถูกใช้ในการค้นพบยาเพื่อคัดกรองสารประกอบที่สามารถปรับเปลี่ยนเส้นทางหลั่ง ได้นำเสนอเป้าหมายบำบัดที่เป็นไปได้สำหรับโรคที่เกี่ยวข้องกับการพับผิดปกติหรือการย้ายตำแหน่งผิดของโปรตีน