ใช้ในงานวิจัยด้านชีววิทยาโมเลกุลเพื่อศึกษาบทบาทของเอนไซม์ DOT1L ซึ่งเกี่ยวข้องกับการควบคุมการแสดงออกของยีนผ่านกระบวนการเมทิลเลชันของฮิสโทน โดยเฉพาะในงานวิจัยโรคมะเร็ง เช่น มะเร็งเม็ดเลือดขาวชนิดลิวคีเมียที่มีการกลายพันธุ์ของยีน MLL เนื่องจาก SGC-0946 สามารถยับยั้งกิจกรรมของ DOT1L ได้อย่างเฉพาะเจาะจง ทำให้ช่วยยับยั้งการเจริญเติบโตของเซลล์มะเร็งที่ขึ้นกับการทำงานของ DOT1L นอกจากนี้ยังใช้เป็นเครื่องมือในการศึกษาเส้นทางสัญญาณภายในเซลล์ที่เกี่ยวข้องกับการเปลี่ยนแปลงของฮิสโทน และพัฒนายาต้านมะเร็งรุ่นใหม่ที่มีกลไกการทำงานเฉพาะเจาะจงมากขึ้น