ใช้เป็นตัวทำปฏิกิริยาในสังเคราะห์สารประกอบเปปไทด์ โดยทำหน้าที่เป็นตัวป้องกันหมู่ฟังก์ชันอะมิโน (amine protecting group) ในขั้นตอนการสร้างพันธะเปปไทด์ ช่วยควบคุมทิศทางของปฏิกิริยาและป้องกันไม่ให้เกิดปฏิกิริยาข้างเคียง โดยเฉพาะในระบบสังเคราะห์เปปไทด์แบบแข็ง (solid-phase peptide synthesis) เนื่องจากหมู่ 4-nitrophenoxy carbonyl สามารถถอดออกได้อย่างมีประสิทธิภาพภายใต้สภาวะที่อ่อนโยน เช่น การใช้พิเพอริดีน ทำให้เหมาะกับการสังเคราะห์เปปไทด์ที่มีความซับซ้อนสูง