ใช้อย่างแพร่หลายเป็นสาร derivatizing ในเคมีวิเคราะห์ โดยเฉพาะในงานก๊าซโครมาโทกราฟี (GC) และสเปกโทรเมตรีมวลสาร (MS) ซึ่งช่วยเพิ่มการตรวจจับและการวัดปริมาณของสารประกอบต่างๆ เช่น กรดคาร์บอกซิลิก ฟีนอล และอะมีน โดยการแปลงให้เป็นอนุพันธ์ที่ระเหยได้ง่ายและวิเคราะห์ได้สะดวกยิ่งขึ้น ใช้บ่อยในงานวิเคราะห์สิ่งแวดล้อมเพื่อตรวจหาระดับร่องรอยของสารมลพิษในตัวอย่างน้ำ ดิน และอากาศ นอกจากนี้ยังนำไปใช้ในงานวิจัยเภสัชกรรมสำหรับการวิเคราะห์เมแทบอลิซึมของยาและสารเจือปน อะตอมฟลูออรีนที่มีฤทธิ์ดึงอิเล็กตรอนแรงช่วยเพิ่มความไวและความจำเพาะในการวิเคราะห์ นอกจากนี้ยังเป็นสารเคมีสำคัญในงานสังเคราะห์อินทรีย์สำหรับการนำกลุ่มเพนตาฟลูออโรเบนซิลเข้าสู่โมเลกุลเป้าหมาย